ضریح مطهر حرم حضرت معصومه سلاماللهعلیها از سال ۹۶۵ق چندین بار ساخته و اصلاح شده است. در سال ۱۳۶۸ش تغییر دوبارۀ آن در دستور کار قرار گرفت و بهدست هنرمندان ارادتمند آن آستان، اصلاح و تعمیر شد و در اسفند ماه ١٣٨٠ش همزمان با عید غدیر خم، در مراسمی با حضور آیتاللهالعظمی بهجت قدسسره رونمایی شد و تا کنون بر مضجع شریف آنحضرت قرار دارد.
از برنامههای دائمی و زیبای حضرت آیتالله بهجت قدسسره، حضور هر روزه در حریم ملکوتی حضرت فاطمه معصومه سلاماللهعلیها بود و تا پایان زندگی سراسر نور و برکت خویش تا آستانه نود سالگی، هر روز پس از نماز صبح و تعقیبات آن، به زیارت ضریح مطهر حضرت فاطمۀ معصومه سلاماللهعلیها میشتافت و سپس در خلوت عاشقانۀ خویش در گوشهای از حرم مطهر به قرائت زیارات و اقامه نماز میپرداخت.
حدود دو ساعت در حرم مشغول زیارت و سایر عبادات بودند. در حرم، زیارت جامعه و امین الله را میخواندند و به خانه بازمیگشتند.
ایشان پس از انجام تعقیبات نماز صبح راهی حرم میشدند. برای مسیر حرم هم برنامه داشتند؛ پیاده به سمت حرم میرفتند و در مسیر ادامه تعقیبات نماز و دعای صباح و یستشیر را میخواندند.
حدود دو ساعت در حرم مشغول زیارت و سایر عبادات بودند. در حرم، زیارت جامعه و امین الله را میخواندند و به خانه بازمیگشتند.